notI (Nocardia otitidiscaviarum)

Vorhandene Strukturdaten: 3BVQ, 3C25
Masse/Länge Primärstruktur 383 Aminosäuren
Sekundär- bis Quartärstruktur Homodimer
Bezeichner
Gen-Name(n) notI (Rebase)
Externe IDs UniProtQ2I6W2
Enzymklassifikation
EC, Kategorie 3.1.21.4  Restriktionsenzym
Reaktionsart Hydrolyse
Substrat DNA
Produkte Zweisträngige DNA-Fragmente mit terminalen 5'-Phosphatgruppen

Das Enzym Not I ist ein Restriktionsenzym vom Typ II, eine Endonuklease, die DNA an einer spezifischen Stelle schneidet. Das Enzym wurde aus dem Bakterium Nocardia otitidis-cavarium isoliert. Es besitzt eine sequenzspezifische Erkennungsstelle auf der DNA, an der es spezifisch binden und die DNA an dieser Stelle schneiden kann. Das zugehörige Gen wurde sequenziert und kloniert.

Erkennungssequenz Restriktionsschnitt
5'-GCGGCCGC-3'
3'-CGCCGGCG-5'
5'-GC       GGCCGC-3'
3'-CGCCGG       CG-5'

Bei der Durchtrennung der DNA entstehen einzelsträngige Überhänge, die aufgrund ihrer Affinität zu komplementären Sequenzen als sticky ends bezeichnet werden. Im Experiment kann das Enzym durch Hitze-Denaturierung, beispielsweise bei 65 °C für 20 Minuten, inaktiviert werden.

Literatur

  • Giedre Tamulaitiene & Virginijus Siksnys (2008): NotI is not boring. In: Structure. Bd. 16, Nr. 4, S. 497-498. PMID 18400171

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E

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